自(zì )西元20XX年,人类从肯(🍩)亚(yà )图尔卡(kǎ )纳湖的湖(hú )畔挖(🕰)出(chū )了一个(🎺)名叫索(suǒ )(🎹)哈尔(Zohar)的物体之后(hòu ),便开始(⏬)对(duì )(🎲)它进(jìn )行(🌗)研究,后来(lái )有(yǒu )人重建(🕔)出来所谓(🤷)的“神之语(yǔ )言”,并建立电脑程式以启动(🛺)原始索哈(hā )尔,进行(✖)和上位(🚸)领(lǐng )域的U-DO(上位领域当中的红色波(🔩)动(dòng )存(cún )在(zài ))连结的(de )连结实验,但(🌑)很不幸(xìng )地(🥎),从(💻)上位(wèi )领(📙)域流入(🐑)下位(wèi )领(🤠)域的能量造成了(le )(🙉)事象变移,使地球(游戏(xì )中所谓的(🕙)“失(shī )落(💠)耶路(lù )撒冷(🤳)”)几(jǐ )乎完从从宇(yǔ )宙中“消失”,人(rén )类(lèi )因(💹)而被迫逃亡(👊),离开地球。到了四千(🐛)年多后(hòu )(🐨),在(zài )故事开始前十(🚶)五的T.C.4753年(nián ),米尔奇(🔍)亚行(háng )(🤥)星(⏲)(Miltia)爆发了所谓的(🏃)米尔奇亚冲突事件,在此次事件当(🔥)中(zhōng ),米尔(⏳)奇亚(🚽)行星的人(rén )类疑似(sì )(👗)遭到(dào )了格诺西(xī )斯(Gnosis)的(de )攻击,并在冲突事(⛴)件后消(xiāo )失(🈺),但事件的(🈳)真(🐈)相(🔬)却因为米(💕)尔奇亚的(🐱)消失而不(bú )为(wéi )人知。在事件后,启动原始(🚓)索哈尔(后(🔍)来(lái )人类(🗒)制(zhì )造(🐣)出了十二具(jù )索(🍝)哈尔(ěr )模拟体,因此原有(yǒu )(🔝)的索哈尔就(♈)被称(chēng )之为原始索(suǒ )(😂)哈(😙)尔)所(suǒ )需的(de )神之语(📸)言、(🌽)原始索哈尔(ěr )的研究成果、(🌸)米尔奇亚的U.M.N.座(⏩)标等事物,都(dōu )被封存在Y资(zī )料当中,而Y资(zī )料又(🍆)被(💽)封存在(zài )百式观(🆕)测用合成人(Relian)M.O.M.O.的(de )意识内(🤖),然(🚞)而(🈲)这么(me )做(🎆)却引起了各方(fāng )势力对M.O.M.O.的(de )争夺,因此星团(😍)联邦政府(游(yóu )戏中(😋)统治各行星(💼)的政(🌻)府(fǔ ),英文名Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的(🏃)生化人(Cyborg),以保护M.O.M.O.的安(🔝)全。另一(🥖)方面,在米(mǐ )尔奇亚(🔷)冲(chōng )(🤼)突事(shì )件(🍀)结(jié )束后的十几(jǐ )年,也就是大约在游(yóu )戏EPI开始的时候(🥐),当(dāng )时最大的(📊)企业贝(🏜)克(🔅)达公(gōng )司以对抗格(💁)诺(nuò )西(📓)斯(sī )侵(🈴)扰(rǎo )的名义,进(👋)行对格诺西斯用战斗兵器KOS-MOS的(de )(🌚)开(kāi )发计划,但(dàn )和当(🀄)时多使用(🏟)合成人(Relian)与(yǔ )生化人(Cyborg)的情(🚁)况(kuàng )所不同的是(⚾),KOS-MOS是个纯粹的机械制品。另一方(fāng )面,在EPI开始时(♑),参(cān )与(yǔ )KOS-MOS开发(fā )计(jì )划的贝克达公司(🏽)第一开发局研(yán )究人员(😯)卯月紫苑,正乘着当时载有还没正式(shì )启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进(jìn )行旅途。但没想到其太空船却(què )被(bèi )冲(chōng )著索哈尔(😄)而来的格(gé )诺西斯所(❎)攻击(👼),而KOS-MOS也在此(🥚)时突然(rán )启动,卯月(🍉)紫苑因而被(bèi )卷入一(yī )连串和格(🔙)诺西斯及(jí )索(suǒ )哈(💳)尔(👲)有关的(⏺)阴谋,以(yǐ )及会(huì )改变人类命运(🍮)的事件当中……