自西元20XX年,人(rén )类从肯亚(🔼)图(tú )(🌰)尔(🃏)卡纳湖的湖(hú )(🛍)畔(pàn )挖(wā )出了(le )一(yī )个(gè )名叫索哈尔(ěr )(Zohar)的物(wù )体之后,便开始对它(🎏)进行(🌗)研究,后来有人重建出(🔸)来所谓的(de )“神(🎡)之语言”,并(bìng )建立电(🛹)脑程式(🚥)以启(qǐ )动(🛺)原始(🎿)索哈尔,进行和(🙁)上位领域的U-DO(上位领域当中(🌙)的红(🧚)色波动(🥁)存(cún )在(zài ))连结(⏯)的连结实验(yàn ),但(🌑)很不幸地,从上位领域(yù )流入(🐑)下位领域的能量造成了事象(⛓)变(🎾)移,使地球(游(👃)戏中所谓的“失落耶路(lù )撒冷(lěng )(🤳)”)几(🕐)乎完从从宇宙(⚾)中“消失(🗳)”,人类(💝)因而被(bèi )迫逃(táo )亡(👊),离开地球。到了四(🏻)千年多后(🐨),在(🥋)故事(shì )开(🌪)始前十五的T.C.4753年,米尔奇(qí )亚行星(Miltia)爆(bào )发了所谓的米(mǐ )尔(ěr )奇亚(yà )冲(🔎)突事件,在此次(cì )事(🔫)件(jiàn )当中,米尔(⏳)奇亚(🚽)行(🎐)星的人类(🕕)疑(😳)似遭到了(le )(🚻)格诺西斯(Gnosis)的(✖)攻(🕺)击(💑),并在冲突事件后(hòu )(❄)消(💁)失,但(🧥)事(shì )件的真相却因为米尔奇(🚪)亚的消失而(ér )不为(wéi )人知。在事件后(hòu )(🛃),启动原(yuán )始索哈(hā )(🐇)尔(后(hòu )来(lái )人(rén )类制(zhì )造出了十二(èr )具索哈尔模拟体,因此原(yuán )(♟)有的索哈尔就被称(🍗)之为原始索(😂)哈尔)所需的神之语(yǔ )言、原始索(suǒ )哈(hā )尔的研(yán )究成果、(🌸)米尔奇亚(yà )的U.M.N.座标等事物,都被封存在(🦀)Y资料当中,而(ér )Y资(😕)料又被(bèi )封存(🌄)在百式观测用合成(chéng )人(rén )(Relian)M.O.M.O.的意识内(🤖),然而(ér )(🈲)这么做(🎆)却引(yǐn )起了各(gè )方(🚬)势力对M.O.M.O.的争夺(duó ),因此(cǐ )星团(😍)联(🏥)邦政府(游戏中统治各行(háng )星的(de )(🗄)政府,英文(💻)名(míng )Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的(de )生化人(rén )(Cyborg),以保护(hù )M.O.M.O.的安全。另(lìng )一方(✝)面,在米尔奇亚冲突(💦)事件结(jié )束后(hòu )的十几年(🐑),也就是(shì )大约在游戏EPI开始的时候,当(dāng )(👕)时最大的(📊)企业贝克达公(gōng )司(sī )以对抗(🖼)格诺西斯侵(🈴)扰的名(míng )义,进行对(🥤)格诺西斯用战斗(dòu )(🙈)兵器(qì )KOS-MOS的开(🧤)发计划,但(🚁)和(🗼)当时多使用合(🍚)成人(Relian)与生化(huà )人(😾)(Cyborg)的情况所不(bú )同的是,KOS-MOS是个(gè )纯粹的机(🔢)械(xiè )(🚊)制品。另一方(🈁)面,在EPI开(kāi )始时,参与KOS-MOS开(📠)发(fā )计(jì )划(huá )的贝克达(dá )公司(🏽)第(dì )一(🗝)开发(fā )局研究人(🕙)员卯月紫苑,正乘着当时载(zǎi )有还没正式(🚲)启动的(🚒)KOS-MOS的Woglinde号太空(🍶)船进行旅途。但没(♟)想(✒)到其(qí )太空船却被冲著(zhe )索(suǒ )哈尔而来的格诺西斯所(suǒ )攻(gōng )击,而(ér )KOS-MOS也在此时突(🐉)然启动,卯月紫苑因(🌭)而被(📲)卷入(💝)一连串和格诺西斯(🤯)及索哈(hā )尔有(yǒu )(🔐)关的阴(yīn )谋,以及会(📣)改变人(rén )类命运的事(shì )件当(🔣)中……(👃)